TNFRSF8

TNFRSF8
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1D01
Ідентифікатори
Символи	TNFRSF8, CD30, D1S166E, Ki-1, tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, TNF receptor superfamily member 8
Зовнішні ІД	OMIM: 153243 MGI: 99908 HomoloGene: 949 GeneCards: TNFRSF8
Онтологія гена Молекулярна функція • активність трансмембранного сигнального рецептора • tumor necrosis factor-activated receptor activity • nerve growth factor binding Клітинна компонента • цитоплазма • інтегральний компонент мембрани • інтегральний компонент плазматичної мембрани • екзосома • мембрана • клітинна мембрана • клітинне ядро • neuron projection Біологічний процес • apoptotic signaling pathway • cellular response to mechanical stimulus • response to lipopolysaccharide • inflammatory response • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0072468 сигнальна трансдукція • негативна регуляція проліферації клітин • позитивна регуляція апоптозу • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • axon guidance • negative regulation of neuron projection development • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	943	21941
Ensembl	ENSG00000120949	ENSMUSG00000028602
UniProt	P28908	Q60846
RefSeq (мРНК)	NM_001243 NM_001281430 NM_152942	NM_009401
RefSeq (білок)	NP_001234 NP_001268359	NP_033427
Локус (UCSC)	Хр. 1: 12.06 – 12.14 Mb	Хр. 4: 144.99 – 145.04 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TNFRSF8 (англ. TNF receptor superfamily member 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 595 амінокислот, а молекулярна маса — 63 747.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRVLLAALGL		LFLGALRAFP		QDRPFEDTCH		GNPSHYYDKA		VRRCCYRCPM
GLFPTQQCPQ		RPTDCRKQCE		PDYYLDEADR		CTACVTCSRD		DLVEKTPCAW
NSSRVCECRP		GMFCSTSAVN		SCARCFFHSV		CPAGMIVKFP		GTAQKNTVCE
PASPGVSPAC		ASPENCKEPS		SGTIPQAKPT		PVSPATSSAS		TMPVRGGTRL
AQEAASKLTR		APDSPSSVGR		PSSDPGLSPT		QPCPEGSGDC		RKQCEPDYYL
DEAGRCTACV		SCSRDDLVEK		TPCAWNSSRT		CECRPGMICA		TSATNSCARC
VPYPICAAET		VTKPQDMAEK		DTTFEAPPLG		TQPDCNPTPE		NGEAPASTSP
TQSLLVDSQA		SKTLPIPTSA		PVALSSTGKP		VLDAGPVLFW		VILVLVVVVG
SSAFLLCHRR		ACRKRIRQKL		HLCYPVQTSQ		PKLELVDSRP		RRSSTQLRSG
ASVTEPVAEE		RGLMSQPLME		TCHSVGAAYL		ESLPLQDASP		AGGPSSPRDL
PEPRVSTEHT		NNKIEKIYIM		KADTVIVGTV		KAELPEGRGL		AGPAEPELEE
ELEADHTPHY		PEQETEPPLG		SCSDVMLSVE		EEGKEDPLPT		AASGK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Lee S.Y., Park C.G., Choi Y. (1996). T cell receptor-dependent cell death of T cell hybridomas mediated by the CD30 cytoplasmic domain in association with tumor necrosis factor receptor-associated factors. J. Exp. Med. 183: 669—674. PMID 8627180 doi:10.1084/jem.183.2.669
• Boucher L.-M., Marengere L.E., Lu Y., Thukral S., Mak T.W. (1997). Binding sites of cytoplasmic effectors TRAF1, 2, and 3 on CD30 and other members of the TNF receptor superfamily. Biochem. Biophys. Res. Commun. 233: 592—600. PMID 9168896 doi:10.1006/bbrc.1997.6509
• Ye H., Park Y.C., Kreishman M., Kieff E., Wu H. (1999). The structural basis for the recognition of diverse receptor sequences by TRAF2. Mol. Cell. 4: 321—330. PMID 10518213 doi:10.1016/S1097-2765(00)80334-2

Див. також

• Хромосома 1